Crear carpetas dentro de la carpeta aplicaciones

Buenas

Soy usuario de Mac desde hace año y medio y tengo la siguiente cuestión:

no entiendo muy bien como funciona la carpeta aplicaciones, supongo que el hecho de que para instalar programas solo sea necesario arrastrar el icono en cuestión a la misma significa que no es una carpeta como las demás. Por eso siempre he tenido la siguiente duda: quiero crear cierta jerarquía dentro de esa carpeta, y en lugar de tener todos los programas sueltos dividirlos en (sub)carpetas, por ejemplo: reproductores (y meter el Itunes, el VLC..), navegadores (safari, firefox...), editores de texto... y así. ¿Hay algún inconveniente? ¿los programas seguiran funcionando y reconociendo su ruta sin problema?

Muchísimas gracias por la atención

Haggio